Την καριέρα του στη μουσική δεν διερεύνησε ο Κίλιαν Μέρφι, επειδή δεν πίστευε ότι ήταν «αρκετά καλός», όπως είπε σε συνέντευξή του στο NME. Ο πρωταγωνιστής της ταινίας «Oppenheimer» μίλησε, επίσης, και για την αγάπη του για τον Frank Zappa και τους Beatles.
Έχοντας ως πηγή έμπνευσης τους Beatles, ο Μέρφι και ο αδελφός του, δημιούργησαν ακόμη και το δικό τους συγκρότημα: The Sons of Mr Green Genes, που πήρε το όνομά του από μια μελωδία του Zappa από το άλμπουμ του 1969 «Hot Rats».
Τα τραγούδια του συγκροτήματος του Μέρφι ήταν παρόμοια πειραματικά, με «εκκεντρικούς στίχους και ατελείωτα σόλο κιθάρας». Τελικά, τους προσφέρθηκε μια συμφωνία για πέντε άλμπουμ από την Acid Jazz που εδρεύει στο Λονδίνο, αλλά ο ηθοποιός και ο αδελφός τους την απέρριψαν, επικαλούμενοι λόγους καλλιτεχνικής ανεξαρτησίας.
Ο Κίλιαν Μέρφι όταν ρωτήθηκε για την ταινία μικρού μήκους του 2002 Watchmen – τη μοναδική του απόπειρα συγγραφής σεναρίου την υποτίμησε. «Απλώς ποτέ δεν σκέφτηκα ότι ήμουν αρκετά καλός πραγματικά» είπε. «Γι’ αυτό, ξέρετε, δεν ασχολήθηκα ούτε με τη μουσική. Μου αρέσει να κάνω ένα πράγμα αρκετά καλά» ανέφερε ο ηθοποιός και πρόσθεσε ότι είναι απίθανο αυτό να αλλάξει στο μέλλον.
